Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp11Q99K46 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp11Q99K46 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp11Q99K46 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp11Q99K46 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp11Q99K46 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp11Q99K46 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp11Q99K46 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp11Q99K46 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Usp11Q99K46 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp11Q99K46 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp11Q99K46 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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Usp11Q99K46 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp11Q99K46 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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