Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Def8Q99J78 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Def8Q99J78 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Def8Q99J78 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms