Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PdgfdQ925I7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms