Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 828 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nrif1Q923B3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Nrif1Q923B3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Nrif1Q923B3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Nrif1Q923B3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Nrif1Q923B3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nrif1Q923B3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nrif1Q923B3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nrif1Q923B3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Nrif1Q923B3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Nrif1Q923B3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nrif1Q923B3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Nrif1Q923B3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms