Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clip1Q922J3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clip1Q922J3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clip1Q922J3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms