Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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Med28Q920D3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Med28Q920D3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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