Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atl3Q91YH5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atl3Q91YH5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms