Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Cep57l1Q8VDS7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cep57l1Q8VDS7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cep57l1Q8VDS7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cep57l1Q8VDS7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cep57l1Q8VDS7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Cep57l1Q8VDS7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cep57l1Q8VDS7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cep57l1Q8VDS7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Cep57l1Q8VDS7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cep57l1Q8VDS7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms