Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms