Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubxn4Q8VCH8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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