Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OptnQ8K3K8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms