Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

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Length 813 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp45Q8K387 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp45Q8K387 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp45Q8K387 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp45Q8K387 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp45Q8K387 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp45Q8K387 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp45Q8K387 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp45Q8K387 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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