Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Depp1Q8K2F3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms