Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Cldn34c1Q8K193 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Cldn34c1Q8K193 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Cldn34c1Q8K193 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Cldn34c1Q8K193 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cldn34c1Q8K193 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Cldn34c1Q8K193 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c1Q8K193 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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