Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Card11Q8CIS0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Card11Q8CIS0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms