Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Ercc8Q8CFD5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Ercc8Q8CFD5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Ercc8Q8CFD5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Ercc8Q8CFD5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Ercc8Q8CFD5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ercc8Q8CFD5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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