Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Nhlrc3Q8CCH2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Nhlrc3Q8CCH2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Nhlrc3Q8CCH2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Nhlrc3Q8CCH2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Nhlrc3Q8CCH2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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