Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spef2Q8C9J3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spef2Q8C9J3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spef2Q8C9J3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spef2Q8C9J3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spef2Q8C9J3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spef2Q8C9J3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spef2Q8C9J3 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spef2Q8C9J3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms