Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ppfibp1Q8C8U0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ppfibp1Q8C8U0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms