Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tsr2Q8C8T8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tsr2Q8C8T8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms