Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms