Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lmod1Q8BVA4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lmod1Q8BVA4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms