Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp43Q8BUM9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp43Q8BUM9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp43Q8BUM9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms