Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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