Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tnpo1Q8BFY9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tnpo1Q8BFY9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tnpo1Q8BFY9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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