Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChfrQ810L3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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ChfrQ810L3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ChfrQ810L3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms