Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Smim19Q80ZU4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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