Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Alkbh8Q80Y20 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms