Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Npm2Q80W85 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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Npm2Q80W85 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Npm2Q80W85 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Npm2Q80W85 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Npm2Q80W85 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Npm2Q80W85 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npm2Q80W85 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npm2Q80W85 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npm2Q80W85 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npm2Q80W85 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npm2Q80W85 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Npm2Q80W85 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npm2Q80W85 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Npm2Q80W85 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npm2Q80W85 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Npm2Q80W85 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Npm2Q80W85 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
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