Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccp110Q7TSH4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccp110Q7TSH4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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