Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Snx13Q6PHS6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms