Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ecm29Q6PDI5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms