Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trak1Q6PD31 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trak1Q6PD31 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trak1Q6PD31 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms