Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trim37Q6PCX9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim37Q6PCX9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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