Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
CltbQ6IRU5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms