Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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