Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

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Length 1,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Fndc3c1Q6DFV6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Fndc3c1Q6DFV6 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Fndc3c1Q6DFV6 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Fndc3c1Q6DFV6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Fndc3c1Q6DFV6 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc3c1Q6DFV6 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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