Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ca4Q64444 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ca4Q64444 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ca4Q64444 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ca4Q64444 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ca4Q64444 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ca4Q64444 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ca4Q64444 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ca4Q64444 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ca4Q64444 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ca4Q64444 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ca4Q64444 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ca4Q64444 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ca4Q64444 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ca4Q64444 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ca4Q64444 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms