Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Ccdc18Q640L5 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc18Q640L5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms