Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col4a5Q63ZW6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms