Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pabpc2Q62029 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms