Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ecm1Q61508 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ecm1Q61508 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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