Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pde3bQ61409 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pde3bQ61409 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms