Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usf1Q61069 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usf1Q61069 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usf1Q61069 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usf1Q61069 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usf1Q61069 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usf1Q61069 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usf1Q61069 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf1Q61069 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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