Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Klf3Q60980 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms