Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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JrkQ60976 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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JrkQ60976 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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JrkQ60976 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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JrkQ60976 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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JrkQ60976 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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JrkQ60976 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms