Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Rbbp4Q60972 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms