Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stxbp3Q60770 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stxbp3Q60770 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Stxbp3Q60770 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stxbp3Q60770 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stxbp3Q60770 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stxbp3Q60770 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stxbp3Q60770 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stxbp3Q60770 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stxbp3Q60770 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stxbp3Q60770 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stxbp3Q60770 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stxbp3Q60770 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stxbp3Q60770 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stxbp3Q60770 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms