Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prdm1Q60636 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms