Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CttnQ60598 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CttnQ60598 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms